南京審計學院總共有25個專業(yè)。

南京審計學院本科專業(yè)有24個：保險、稅務、信息管理與信息系統(tǒng)、計算機科學與技術、工程管理、投資學、會計學、信用管理、財政學、財務管理、金融學、電子商務、國際經(jīng)濟與貿(mào)易、市場營銷、人力資源管理、經(jīng)濟學、工商管理、審計學、行政管理、法學、統(tǒng)計學、數(shù)學與應用數(shù)學、對外漢語、英語。

南京審計學院其他專業(yè)有1個：物流管理。