新疆大學科學技術學院總共有15個專業(yè)。

新疆大學科學技術學院本科專業(yè)有14個：土木工程、英語、過程裝備與控制工程、俄語、通信工程、國際經濟與貿易、金融學、市場營銷、工商管理、旅游管理、信息管理與信息系統(tǒng)、法學、計算機科學與技術、電氣工程及其自動化。

新疆大學科學技術學院其他專業(yè)有1個：物流工程。