新疆醫(yī)科大學(xué)總共有26個專業(yè)。

新疆醫(yī)科大學(xué)本科專業(yè)有25個：醫(yī)學(xué)技術(shù)、預(yù)防醫(yī)學(xué)、醫(yī)學(xué)實驗學(xué)、醫(yī)學(xué)影像學(xué)、中醫(yī)學(xué)、護(hù)理學(xué)、衛(wèi)生檢驗、藥學(xué)、中藥資源與開發(fā)、法醫(yī)學(xué)、維醫(yī)學(xué)、麻醉學(xué)、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、中西醫(yī)臨床醫(yī)學(xué)、針炙推拿學(xué)、中藥學(xué)、婦幼保健醫(yī)學(xué)、醫(yī)學(xué)檢驗、臨床醫(yī)學(xué)（7年制）、口腔醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)（5年制）、生物醫(yī)學(xué)工程、信息管理與信息系統(tǒng)、公共事業(yè)管理、英語。

新疆醫(yī)科大學(xué)其他專業(yè)有1個：針灸推拿學(xué)。