濟寧醫(yī)學(xué)院總共有25個專業(yè)。

濟寧醫(yī)學(xué)院本科專業(yè)有19個：藥學(xué)、生物技術(shù)、藥物制劑、英語、臨床醫(yī)學(xué)、康復(fù)治療學(xué)、計算機科學(xué)與技術(shù)、醫(yī)學(xué)影像學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)、市場營銷、醫(yī)學(xué)檢驗、勞動與社會保障、口腔醫(yī)學(xué)、中西醫(yī)臨床醫(yī)學(xué)、人力資源管理、護理學(xué)、信息管理與信息系統(tǒng)、公共事業(yè)管理、應(yīng)用心理學(xué)。

濟寧醫(yī)學(xué)院其他專業(yè)有6個：法醫(yī)學(xué)、生物工程、食品質(zhì)量與安全、中藥學(xué)、生物醫(yī)學(xué)工程、制藥工程。