南京理工大學總共有83個專業(yè)。

南京理工大學本科專業(yè)有72個：材料成型及控制工程、網(wǎng)絡工程、武器系統(tǒng)與工程、彈藥工程與爆炸技術(shù)、建筑環(huán)境與設備工程、信息對抗技術(shù)、測控技術(shù)與儀器、電氣工程及其自動化、熱能與動力工程、電機與電器、工程力學、真空電子技術(shù)、電子信息工程、探測制導與控制技術(shù)、土木工程、計算機科學與技術(shù)、探測制導與測控技術(shù)、環(huán)境工程、自動化、高分子材料與工程、納米材料與技術(shù)、安全工程、機械工程及自動化、通信工程、生物工程、新能源科學與工程、化學工程與工藝、電氣工程與自動化、輻射防護與環(huán)境工程、國際經(jīng)濟與貿(mào)易、軟件工程、材料科學與工程、金融學、交通工程、工業(yè)設計、電子科學與技術(shù)、光電信息工程、武器系統(tǒng)與發(fā)射工程、車輛工程、經(jīng)濟學、制藥工程、探測制導與控制技術(shù)、武器、特種能源工程與煙火技術(shù)、經(jīng)濟學、彈藥工程與發(fā)射工程、電子商務、信息管理與信息系統(tǒng)、社會工作、化學、工業(yè)工程、廣播電視新聞學、工商管理、思想政治教育、藝術(shù)設計、市場營銷、英語、法學、法語、數(shù)學與應用數(shù)學、會計學、信息與計算科學、人力資源管理、應用物理學、電子信息科學與技術(shù)、財務管理、光信息科學與技術(shù)、公共事業(yè)管理、材料化學、工商管理、材料學、管理科學與工程。

南京理工大學其他專業(yè)有11個：微電子學、機械、日語、統(tǒng)計學、電氣信息、智能電網(wǎng)信息工程、數(shù)學、化工與制藥、材料物理、飛行器設計與工程、材料。