上海中醫(yī)藥大學中藥學院總共有21個專業(yè)。

上海中醫(yī)藥大學中藥學院本科專業(yè)有14個：中醫(yī)學（運動醫(yī)學方向）、針灸推拿學、中西醫(yī)臨床醫(yī)學、中藥學、藥學類（中外合作辦學）、中醫(yī)學（基礎醫(yī)學方向）、中醫(yī)學(臨床方向)、康復治療學（中西醫(yī)結合方向）、中醫(yī)學（針灸推拿英語方向）、護理學、中醫(yī)學（中醫(yī)方向）、營養(yǎng)學、中醫(yī)學（骨傷科學方向）、公共事業(yè)管理（衛(wèi)生管理方向）。

上海中醫(yī)藥大學中藥學院?？茖I(yè)有7個：護理類（中外合作辦學）、康復治療技術（老年管理與服務方向）、醫(yī)療美容技術（中醫(yī)美容方向）、醫(yī)學營養(yǎng)（中醫(yī)營養(yǎng)方向）、護理（梅隴教學點）、醫(yī)學營養(yǎng)（營養(yǎng)與衛(wèi)生方向）（梅隴教學、中藥制藥技術。