藥學(xué)專業(yè)從2003年開始籌建，于2005年掛靠在化學(xué)學(xué)院開始招收本科生，2007年藥學(xué)院正式成立，2008年9月藥學(xué)專業(yè)本科生學(xué)籍全部轉(zhuǎn)入藥學(xué)院。

專業(yè)培養(yǎng)目標(biāo)：根據(jù)南開大學(xué)“公能”素質(zhì)教育“以德為先，能力為重、全面發(fā)展、勇于創(chuàng)新”的核心理念，以“課堂教學(xué)、校園文化、社會(huì)實(shí)踐”三位一體的人才培養(yǎng)模式，堅(jiān)持全員育人、全過程育人和全方位育人，著力培養(yǎng)信念執(zhí)著、品德優(yōu)良、知識(shí)豐富、本領(lǐng)過硬的高素質(zhì)專門人才和拔尖創(chuàng)新人才。 本專業(yè)按一級(jí)學(xué)科招收本科生，按“前期趨同，后期分化”的原則實(shí)施教學(xué)，以知識(shí)結(jié)構(gòu)多元化為目標(biāo)，即學(xué)生在前2.5～3年，學(xué)好藥學(xué)、生物、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、化學(xué)、語言等基礎(chǔ)課程，后1～1.5年學(xué)生根據(jù)自己的興趣愛好自由選擇藥學(xué)、藥物化學(xué)、藥物分析、藥物制劑和生物藥物（非發(fā)酵專業(yè)）等感興趣的方向進(jìn)行學(xué)習(xí)和研究。

專業(yè)主要課程：藥物化學(xué)、藥物分析、藥劑學(xué)、藥理學(xué)、生物化學(xué)、天然藥物學(xué)、人體解剖生理學(xué)、無機(jī)分析化學(xué)、有機(jī)化學(xué)、物理化學(xué)、藥學(xué)綜合實(shí)驗(yàn)等19門必修課程；另有41余門選修課供學(xué)生根據(jù)自身情況選擇。我們與化學(xué)院、生命科學(xué)院和醫(yī)學(xué)院密切合作，以上述課程為基礎(chǔ)，把專業(yè)分為三個(gè)研究方向：藥化方向、藥劑方向和生物方向，讓學(xué)生根據(jù)自己的興趣愛好自由選擇感興趣的方向進(jìn)行學(xué)習(xí)和研究。

就業(yè)方向：畢業(yè)后能盡快適應(yīng)在藥物研究、開發(fā)、生產(chǎn)、檢驗(yàn)、流通和使用等藥學(xué)領(lǐng)域從事藥物前期設(shè)計(jì)、合成和篩選，藥物生產(chǎn)、藥物制劑與劑型的設(shè)計(jì)制備、藥物分析及質(zhì)量監(jiān)控、藥物臨床使用和監(jiān)督管理等方面的科學(xué)研究、開發(fā)、應(yīng)用、教學(xué)與管理等工作。