安徽中醫(yī)藥大學總共有18個專業(yè)。

安徽中醫(yī)藥大學本科專業(yè)有16個：中藥學、護理學、藥物制劑、計算機科學與技術(shù)、中藥資源與開發(fā)、康復治療學、制藥工程、中醫(yī)學、國際經(jīng)濟與貿(mào)易、針灸推拿學、信息管理與信息系統(tǒng)、中西醫(yī)臨床醫(yī)學、藥學、人力資源管理、公共事業(yè)管理、應(yīng)用心理學。

安徽中醫(yī)藥大學其他專業(yè)有2個：對外漢語、醫(yī)療器械工程。